皆様、いろいろなご意見ありがとうございます！

今回、苦肉の策で色変えが必要なフィールドをリッチエディターにしました。
入力の際、画面がエディターだらけになってちょっとキモイのですが：笑
何度も変更があったりするパターンもあるので、入力担当には我慢してもらってって感じです。
（むしろ、入力担当はいろいろと細かく出来てこっちの方が良い！って言ってますし。。）
この文字色変更問題以外は出来るだけ自動にしたりと手間を省く工夫はしています。　

まだまだ、基本機能や無料プラグインでお金をかけないで出来る事、たくさんありそうでうすね。
しかし、これにこだわり過ぎて使いにくものになってしまったら本末転倒なので、使いやすさ最優先で基本機能などきわめていこうと思います。（来年の目標！）

恐らくですが、キントーンの標準機能の「レコード印刷」では、その印刷画面時に表示されるカラーが優先されると思います。
詳細画面のカラー印刷ならこっちの会社さんのが良さそうです。
https://www.novelworks.jp/kintone_plugin/easy_form_designer-2

一応ベータ版で無料で使えるそうです。

追記です。
PDFにする際というか、「印刷設定プラグイン(TIS)」を使って「印刷する」にした際にすでに黒文字に戻ってしまいます。