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カスタマーサポートに問い合わせるのも一つの手かと思います。

⇒スペーステンプレートでごっそり移行
中略
・②のリンク使用の確認はアプリ開いたりで地道にやるしかないか
・③のプラグインのインストール一気にできたりはしないか

スペーステンプレートの実行したことはないのですが．．．
「アプリテンプレート」の場合は
②・・・「リンクごとテンプレート」になります
　　　　（＝テンプレートの中に複数のアプリが含まれる）
　　　　【但し、ﾃﾞﾌｫﾙﾄのみ（Look Up／関連ﾚｺｰﾄﾞ一覧 など）】
③・・・Pluginも一緒にアプリ内に入っています、なので
　　　　事前に、移行先にPluginを読み込んでおけば、設定のみです

　（設定等も一個ずつですよね…）

Pluginごとに設定は必要ですが．．．Pluginによっては
設定を「ｴｸｽﾎﾟｰﾄ」「ｲﾝﾎﾟｰﾄ」出来るものがありますので、確認をお勧めします
知っているは
・条件分岐処理プラグイン（🐼商会）
・Boost! ｼﾘｰｽﾞ（🐼商会）...半分確認
・Ribbit's worksの一部

なお、移行後にPluginの動作に問題が発生した場合は
プラグインの実行順序について【1つのアプリに、複数の Plugin が ｲﾝｽﾄｰﾙ されている場合、Plugin実行順序の確認と変更方法】
の確認を最初されることをお勧めします

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追記

事前に、

の対応（＝調査）は（ｼｽﾃﾑ管理権限が必要ですが）
kintoneシステム管理＞プラグイン
からできます．．．参考画像添付

お疲れ様です。
カスタマイズ有りの環境でドメイン越えの移行とは、なかなかの大作業ですね。
データの移行にはkintoneコマンドラインツール（cli-kintone）が使えると便利です。
（特に添付ファイルを扱う場合。ただし、使いこなすには練習が必要かも。）
https://cybozu.dev/ja/kintone/sdk/backup/cli-kintone/

おそらくコメントしてくれる人によって色んな視点があると思いますが、自分が思いつく部分を挙げてみます。

1. 変更履歴は移行できない（なので、データを「証拠」として保存している場合は、環境を残し続けるか、PDF等別手段で保存する必要がある）。
2. スレッド、レコードのコメントの移行はかなり困難（カスタマイズやプラグイン等ならある程度移行可能）。
3. アカウントが変わるので、インポートの際にレコードの「作成者」等を管理している場合、事前に変換する必要がある（辞めた人や辞める人が作ったデータの取扱の検討も必要）。
4. ルックアップを使っている場合、保存後にルックアップ先を変更していたりすると、データが一致せずインポートに失敗することがある。
5. 重複を禁止したルックアップの際にコピーされるフィールドは、インポートする際に再参照されるので、データが書き換わる可能性がある。
6. レコードやフィールドに権限を設定していた場合、インポート後にかけ直す必要がある。
7. もし、レコードIDを顧客番号等に使っていた場合、インポートの際に番号が変わり整合性が取れなくなる（ルックアップに使ってたりすると更に大変）。

移行規模（アプリの数や複雑な構造）が大きい場合、移行させるアプリを絞るのも一つの方法かもしれません。
業者さんに委託するのも一つの方法ですが、この辺の移行作業って、業者さんがどれだけkintoneの開発を熟知してるかと予算で、移行できる内容が変わってきそうな気がします。

同一ドメイン内の移行やバックアップについてはプラグインがいくつかありますが、ドメイン跨ぎ可能なものってあるのかなぁ……。詳しい方いらっしゃいましたら、フォローお願いします。