チェックボックスと複数選択の選択肢はファイル書き出し時に削除した項目も出力される
という仕様を、とある事がきっかけで今日初めて勉強しました。
https://cn.kintone.help/k/ja/id/040181#app_qa_delete_selection_10
削除した選択肢の値がレコードに残っていると、レコードのデータをファイルに書き出した際に、その値も出力されます。
なお、[チェックボックス]フィールドと[複数選択]フィールドは、削除した選択肢の値がレコードに残っていなくても、レコードのデータをファイルに書き出した際に、削除した選択肢のカラム(列)が出力されます。
kintoneヘルプのトラブルシューティングページは改めて読み直すと把握していなかった機能や仕様を学べて勉強になりますね。