BファイルのDataが、どの様なものだか？わかりませんが
想定されるパターンで、テストしてみました。

テーブルの有無で出入力がかわります
1⃣有り---添付 jpg の通り
2⃣無し---１⃣のExcel、A列がなくなる

尚、加工の際は Excelをお勧めします。

理由＝取込エラーの時「エラーCSV」が BOM付きでない為
　　　文字化けして、エラー理由が確認できません！
　　　Excelで取込すると、BOM付きで出力してくれます(＝Excelで確認可)

また、
❶フィールドに重複禁止✔設定されているとき
　レコード番号の紐づけでは取込不可　(確認)
②❶の時は、重複禁止フィールドで紐づけが 可能　(確認)
③必須項目なのに、空Dataは取込できない(未確認)と思います。

一度、テストアプリを作り、ダミーDataを入れて
何度か Dataの出し入れの、練習をされる事をお勧めします。

いくつかの情報を加えました。

加えた情報がフィールド（列）データなのか、レコード（行）データなのかで多少操作が異なりますが、基本機能で実現できると思います。

詳しくは、以下を参照するのがよろしいかと。

ファイルからレコードのデータをアプリに読み込む
https://jp.cybozu.help/k/ja/user/using_app/import_records/import_csv.html

レコード登録・上書き用のファイルの記載形式
https://{サブドメイン}.cybozu.com/k/help/k/user/using_app/import_records/create_csv.html

ココで操作方法をお示しできなくてすみません。